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三江源数据分析中心

  青海大学计算机系的“三江源数据分析中心”创建于2011年7月,2013年11月三江源数据分析中心建设实施完毕,现已开始正式启动运行,可以为不同学科领域的高速发展起到支撑作用。

  三江源数据分析中心的主要设备是高性能计算机。高性能计算机是指在给定的时间内可提供快速计算能力的大型计算机系统,具有很强的并行计算和处理数据的能力,主要特点表现为高速度和大容量,同时配有多种外部和外围设备及丰富的、高功能的软件系统。基础科学研究是高性能计算最主要的应用领域之一。

  高性能计算机典型的应用领域如下:

1. 气象预报:借助超级计算机能够模拟复杂的气流、洋流变化,能够预测天气走向。

2. 计算化学应用:传统的计算化学主要是研究原子和分子尺度的小分子体系的行为和相互作用。在这个领域里使用的计算理论主要包括Hartree-Fock方法(HF)、密度泛函理论(DFT)、多体扰动理论(MBPT)、组态相互作用理论(CI)和藕合簇理论(CC)等。高性能计算机能很好解决这些计算的准确性。

3. 发现生命秘密:从基因学的数据密集型研究到细胞网络模拟,超级计算机将帮助寻找生命的秘密。

  经过前期建设和扩容,目前三江源数据分析中心的主体设备包括如下几套系统:

  1. 浪潮高性能集群系统

  具体配置如下:

  设备名称

  设备型号(基本参数)

  数量

  计算节点机架服务器

  浪潮NF5270M3(其中机架式服务器NF5270M3 19台,刀片式服务器NX5440 29台CPU:2×Intel Xeon E5-2692v2

  (2.2GHz/12c)内存:64G(8×8GB)  DDR3 1600硬盘:1×300G 2.5" SAS 硬盘)

  48

  管理/登陆节点机架服务器

  浪潮NF5270M3(CPU:2×Intel Xeon E5-2620v2(2.1GHz/6c)/7.2GT/15M

  内存:64G(8×8GB) DDR3 1600

  硬盘:2×300GB 2.5寸 SAS)

  2

  I/O节点及存储系统

  浪潮AS500N6、浪潮/SA5224H

  2

  Infiniband高速网络

  Mellanox MIS5030Q-1SFC,3m-IB线缆

  2

  千兆网络

  H3C S1224千兆以太网

  1

  SKVM

  

  1

  操作系统

  Redhat Linux 64

  48

  高性能集群配置环境

  http://49.209.80.140:22

  

  

  计算速度:20.2752万亿次/秒

 有效存储总容量:84TB(RAID5配置)

 软件环境:天梭集群并行环境:MPICH:千兆消息传递并行库;MVAPICH2:万兆/IB消息传递并行库;OpenMPI:高性能消息传递库;天梭编译调试环境:Intel编译、调试软件 ;Intel C++/Fortran 编译器;Intel MKL数学核心库;gun GCC编译器;

  

  

  

  2. 浪潮大数据处理系统

  具体配置如下:

  设备名称

  设备型号(基本参数)

  数量

  计算节点机架服务器

  浪潮NF5270M4数量 22

  CPU:2×Intel Xeon E5-2620 v3(6核)2.4GHz内存:96G(6×16GB)  ECC Registered DDR4 硬盘:2×300G 2.5" SAS 硬盘:8×4TB  3.5" SAS 硬盘

  22

  管理节点机架服务器

  浪潮 NF5270M4 数量2

  CPU:2×Intel Xeon E5-2620 v3(6核)2.4GHz内存:96G(6×16GB)  ECC Registered DDR4 硬盘:2×300G 2.5" SAS 硬盘:2×600G  3.5" SAS

  2

  万兆交换机/万兆网卡

  

  1

  SKVM

  

  2

  操作系统

  Redhat Linux 64

  24

  大数据配置环境

  http://49.209.80.160:8180

  

  

  有效存储总容量:234TB(共704TB,每份数据存储3份)

  浪潮大数据处理软件环境:

  软件名称

  版本

  inspur_edu-4.1+14229-zh.el6.x86_64

  4.1

  Yarn

  2.5.2

  Hdfs

  2.5.2

  Hbase

  0.98

  Hive

  0.12

  

  

  

  

  

  3. DELL 云桌面系统

  具体配置如下:

  

  设备名称

  设备型号(基本参数)

  数量

  计算节点机架服务器

  DELL PowerEdge R720数量 6(目前使用4台);CPU型号:Intel Xeon E5-2670;CPU数量:2颗;内存容量:128GB DDR3

  硬盘:2块 2TB SAS (10k) 3.5寸;

  4

  存储系统

  戴尔DELL /DELL EqualLogic PS4100E

  3TB SAS硬盘,3.5寸,1万转 12块

  1

  千兆以太网交换机

  H3C  S5500

  1

  操作系统

  Certer OS Linux 64

  24

  云桌面配置环境

  http://49.209.80.141

  teacher001-040

  

  

  有效存储总容量:20TB(共36TB,RAID5)

  软件环境:

  软件名称

  数量

  版本

  云计算平台虚拟化系统

  8

  Vmware/Vmware vSphere Enterprise 5

  云计算平台虚拟化控制台系统

  1

  Vmware/Vmware vCenter Standard 5

  云计算平台运营管理系统

  2

  VMware/VMware vCenter Operations 5 Management Suite Advanced

  云远程虚拟桌面

  5(每套管10个点)

  Vmware Horizon 6 10 Pack

  云安全平台

  1

  VMware/Deep Security 8.0

  

  4. IBM刀片集群系统

节点型号:IBM HX5刀片服务器

计算节点数量:30

操作系统:REDHAT LINUX

内存:4 * 4GB (每节点)

处理器:2 * Xeon E7-4820 8C 2.0GHz 24MB Cache 105w

互联网络:InfiniBand(36口QSFP 40GB IS5025)

计算速度:7.68万亿次/秒

存储系统容量:300TB